簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genoty By Sequencing)。這些技術都可以在極短的時間內開發(fā)出成千上萬的SNP 標記,而分子標記是開展遺傳作圖、關聯(lián)分析、群體遺傳分析以及生態(tài)多樣性分析等的基礎,所以利用簡化基因組技術開展科研工作是當前第二代測序技術的一種熱門應用。